酶法工艺生产的麦芽糊精与酸法工艺生产的麦芽糊精的很大区别在于不会析出长链直链淀粉成分，故不会产生白色沉淀物，从而大大提高了麦芽糊精的商品价值。
酶法麦芽糊精放在水中，下沉很快，落在水底中，并能逐渐往上返，同时渐渐溶解，其溶解度略低于砂糖，但水化力较强。一旦吸收水分后，保持水分的能力较强。这是麦芽糊精的一个重要特性，在使用中常常会利用这一特性。
用于饼干或其它方便食品，造型饱满，表面光滑，色泽清亮，外观效果好。产品香脆可口，甜味适中，入口不沾牙，不留渣，次品少，货架期也长。用量5%~10%。麦芽糊精在各色罐头或汤羹汁类食品中，主要的作用是增加稠度，改善结构、外观和风味。用于固体调味料、香料、粉末油脂等食品中，起着稀释、填充的作用，可防潮结块，使产品易贮藏。在粉末油脂中还能起到代用油脂的功能。
蔗糖是一种双糖，在人体消化系统内经过消化液分解成为果糖和葡萄糖，经过肠吸收，过量的蔗糖容易引起蛀牙，由于甜度高，蔗糖摄入过量容易养成宝宝偏爱甜食的坏习惯。麦芽糊精和玉米糖浆类似，是一种没有味道的营养性多糖，具有许多的理化性能，如水溶性好、耐熬煮以及易于人体吸收等。这些特性使它在固体饮料，糖果、饼干、啤酒、婴儿食品、运动员饮料等多种食品加工和生产中得到应用。对婴幼儿营养中的提供能量而言，麦芽糊精与其他类型的碳水化合物并无优劣之分，是等价的。国外在食品中也添加麦芽糊精，改善营养配比，易消化吸收。麦芽糊精在配制功能奶粉，特别是无蔗糖奶粉、婴儿助长奶粉等中的作用已得到确认。
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