亚硫酸可以起到酸性防腐剂的作用，未解离的亚硫酸被认为可抑制酵母菌、霉菌、细菌。据报告，未解离的亚硫酸对大肠的抑制作用比亚硫酸氢根强1000倍。对啤酒酵母强100-500倍，对霉菌强100倍，在酸性时，扛微生物作用强。可作为疏松剂的组成成分。亚硫酸有显著的化作用。由于亚硫酸是强还原剂，能消耗果蔬组织中的氧，抑制氧化酶的活性，对于防止果蔬中的维生素C的氧化破坏很有效。
工业上用于印染、有机合成、印刷、制革、制药等部门；在食品加工中作防腐剂、漂白剂、疏松剂。用作化学试剂（印染和摄影等方面）、用作漂白剂媒染剂，还原剂橡胶凝固剂，也用于有机合成制药及香料等。用途一用作漂白剂、媒染剂、还原剂、橡胶凝固剂，也用于有机合成、制药及香料等用途二用作色谱分析试剂、防腐剂和还原剂，用于染料和制药工业。
运输过程中要确保容器无泄漏、不倒塌、不跌落、不损坏，严禁与氧化剂、酸类、食用化学品等混装混运；焦亚硫酸钠运输途中应防曝晒、雨淋，防高温，车辆运输完毕应进行完整清扫；在储存事宜上面，建议在储存于阴凉、干燥、通风良好的库房，遮光，密封保存，远离火种、热源；焦亚硫酸钠不宜久存，以免变质，储区应备有合适的材料收容泄漏物。
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