在医学，柠檬酸钠的用途也很广泛。利用柠檬酸根与钙离子能形成可溶性络合物的特性，可用作剂和输血剂，保存和加工血制品。柠檬酸钠作为防腐剂，用于保存糖浆等。柠檬酸钠注射时和钾盐一样，用于矫正血液、体液及尿液的酸度，作为化痰剂等。柠檬酸钠与别的试剂配伍可用于提取、纯化动物糖核酸。
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三聚磷酸钠作为助洗剂在洗涤剂中的大量应用是合成洗涤剂工业的一个重要发现。但是，磷酸盐随着洗涤污水排入江河湖泊，造成水质富营养化，促进了水藻类快速繁殖，水中缺氧，危害水生动物的生存，因而成为环保的一大问题。从20世纪70年代起，欧美等发达国家就已经提出了洗涤剂的限磷问题，并先后对其含量作出了规定。在我国，由于各方面原因，特别是价格因素，过去对上述问题并未引起足够重视。随着洗涤剂工业的快速发展，以及水质的不断恶化，洗涤剂行业也正朝着低磷化、无磷化方向发展。
柠檬酸钠在食品、饮料工业中用作酸度调节剂、风味剂、稳定剂。现行标准GB1886.25—2016代替GB6782—2009《食品添加剂 柠檬酸钠》。本标准与GB6782—2009相比，主要变化如下：标准名称修改为“食品安全国家标准 食品添加剂 柠檬酸钠”。
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